MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis 434/Bu chromosome

Total Repeats: 2774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010287	GCA	2	6	1028	1033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010287	TAA	3	9	2920	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010287	T	6	6	2940	2945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010287	T	6	6	2963	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010287	CAA	2	6	5196	5201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010287	TTG	2	6	5207	5212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010287	GAA	2	6	5243	5248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010287	ACA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010287	A	7	7	5301	5307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010287	AGC	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010287	AG	3	6	5331	5336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010287	T	6	6	16262	16267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010287	TGA	2	6	16296	16301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010287	AG	3	6	16350	16355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010287	GCAG	2	8	16435	16442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010287	TTC	2	6	16522	16527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010287	CGG	2	6	16541	16546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010287	GAA	2	6	16630	16635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010287	GC	3	6	16666	16671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010287	TTC	2	6	16672	16677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010287	GAAGA	2	10	16687	16696	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010287	TCA	2	6	16707	16712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010287	GAAA	2	8	16838	16845	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010287	TTC	2	6	16851	16856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010287	TGC	2	6	16865	16870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010287	GAA	2	6	16897	16902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010287	T	6	6	16909	16914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010287	A	6	6	16915	16920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010287	T	11	11	17010	17020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010287	A	8	8	17021	17028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010287	GA	3	6	17039	17044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010287	A	6	6	20957	20962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010287	TAAT	3	12	20972	20983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010287	T	6	6	21009	21014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010287	CTCC	2	8	24844	24851	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_010287	TCTGCA	2	12	24857	24868	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010287	T	8	8	24872	24879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010287	A	6	6	24881	24886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010287	CTT	2	6	26337	26342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010287	CGAG	2	8	26408	26415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_010287	ATGA	2	8	29771	29778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010287	AGAA	2	8	29783	29790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010287	T	7	7	30010	30016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010287	TAT	2	6	30024	30029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010287	T	6	6	32118	32123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010287	TCT	2	6	32161	32166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010287	T	6	6	32244	32249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010287	CGG	2	6	32295	32300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010287	AGA	2	6	32332	32337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010287	CTT	2	6	32494	32499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010287	TC	3	6	32522	32527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010287	AGG	2	6	33276	33281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010287	T	6	6	34296	34301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010287	AAG	2	6	34306	34311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010287	TATTTT	2	12	34334	34345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010287	A	6	6	34362	34367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010287	GC	3	6	34673	34678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010287	TCT	2	6	34699	34704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010287	GT	3	6	38074	38079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010287	CT	3	6	38145	38150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010287	AAT	2	6	38158	38163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010287	GTA	2	6	38171	38176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010287	TCT	2	6	38187	38192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010287	T	6	6	38255	38260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010287	T	6	6	38296	38301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010287	AG	3	6	38317	38322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010287	GA	3	6	38372	38377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010287	ATG	2	6	38410	38415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010287	AGA	2	6	38436	38441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010287	GT	3	6	39472	39477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010287	AGAAT	2	10	39498	39507	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010287	ATTT	2	8	39630	39637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010287	ATG	2	6	39699	39704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010287	AGGGG	2	10	39729	39738	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010287	AG	3	6	39771	39776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010287	ATAC	2	8	39803	39810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010287	GCT	2	6	39875	39880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010287	TCGT	2	8	39948	39955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010287	T	7	7	39962	39968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010287	AGGG	2	8	40113	40120	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010287	TTTA	2	8	43074	43081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010287	TTC	2	6	43083	43088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010287	AG	3	6	43371	43376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010287	TAG	2	6	46135	46140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010287	AG	3	6	48653	48658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010287	TTGC	2	8	48686	48693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010287	G	6	6	53077	53082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010287	GTC	2	6	53187	53192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010287	AGG	2	6	53289	53294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010287	A	7	7	54949	54955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010287	AGGA	2	8	54959	54966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010287	TGA	2	6	54975	54980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010287	AGAA	2	8	54999	55006	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010287	T	7	7	55201	55207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010287	ATTT	2	8	55234	55241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010287	GA	3	6	58290	58295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010287	A	6	6	58331	58336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010287	GC	3	6	58403	58408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010287	TCT	2	6	58453	58458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010287	TTG	2	6	58478	58483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010287	AG	3	6	58487	58492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010287	AGG	2	6	58495	58500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010287	A	8	8	58531	58538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010287	CCGA	2	8	58545	58552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010287	TTA	2	6	58579	58584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010287	TTA	2	6	58588	58593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010287	CT	3	6	59847	59852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_010287	GGC	2	6	59874	59879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010287	AGC	2	6	59952	59957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010287	GAA	2	6	60046	60051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010287	CCT	2	6	60063	60068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010287	AG	3	6	60085	60090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010287	A	7	7	60136	60142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010287	TTG	2	6	60187	60192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010287	GTT	2	6	60241	60246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010287	AAAAG	2	10	60304	60313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010287	TAC	2	6	60368	60373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010287	AAAG	2	8	60374	60381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010287	AGGTA	2	10	63703	63712	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010287	T	6	6	64754	64759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010287	CT	4	8	64771	64778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_010287	T	6	6	64792	64797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010287	T	6	6	64800	64805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010287	TTTG	2	8	64807	64814	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010287	TGT	2	6	64815	64820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010287	T	8	8	64833	64840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010287	CAA	2	6	64853	64858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010287	T	7	7	64860	64866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010287	TCCTT	2	10	64886	64895	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_010287	GA	3	6	64905	64910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010287	TCTT	2	8	64931	64938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010287	T	8	8	64937	64944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010287	A	7	7	64959	64965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010287	T	6	6	64999	65004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010287	ATA	2	6	65017	65022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010287	CTCCA	2	10	65040	65049	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_010287	TGA	2	6	65065	65070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010287	AGG	2	6	65074	65079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010287	AG	3	6	69710	69715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010287	CTGT	2	8	69783	69790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010287	CTA	2	6	72468	72473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010287	A	7	7	72507	72513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010287	A	6	6	72515	72520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010287	AT	5	10	72551	72560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010287	AGG	2	6	72563	72568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010287	A	6	6	72602	72607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010287	CT	3	6	74579	74584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_010287	TTC	2	6	74628	74633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_010287	T	8	8	75972	75979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010287	AGG	2	6	75987	75992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010287	A	6	6	76030	76035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010287	TAAT	2	8	76060	76067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_010287	AAG	2	6	76118	76123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010287	CGG	2	6	76169	76174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_010287	GTT	2	6	81732	81737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010287	TAAA	2	8	81752	81759	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_010287	TC	3	6	84204	84209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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176	NC_010287	TTTCT	2	10	84311	84320	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_010287	GAA	2	6	94541	94546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_010287	TAAGGA	2	12	135520	135531	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_010287	TGT	2	6	135604	135609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_010287	GTG	2	6	135620	135625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_010287	AAT	2	6	135670	135675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010287	ATA	3	9	135700	135708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010287	TAA	2	6	135776	135781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_010287	TGG	2	6	135789	135794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
287	NC_010287	GAA	2	6	135815	135820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_010287	GCG	2	6	136012	136017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_010287	GATG	2	8	136113	136120	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
290	NC_010287	GA	3	6	136150	136155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010287	GACC	2	8	136158	136165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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